Luontojalanjäljen laskennan ytimessä on ymmärrys siitä, miten ja missä luontohaitat syntyvät. Monet organisaatiot ja yritykset ovat lähteneet mukaan yhteistutkimukseen ja kehittämiseen omasta aloitteestaan, sillä he haluavat ymmärtää omia vaikutuksiaan.