DNA:n sijoittuminen ja vuorovaikutukset herpesviruksen reaktivoinnissa

Kromatiinin järjestäytymistä solun tuman sisällä ohjataan useilla tasoilla. Herpesvirukset, kuten Herpes simplex 1 -virus, replikoituvat ja ylläpitävät genomiaan isäntäsolun ytimessä ja hyödyntävät isäntäsolujen ydinrakenteita sekä lyytisen että latentin infektion aikana. Nukleosomien translaation jälkeisen muokkauksen lisäksi isännän kromatiini vuorovaikutusten modulaatio on olennaista viruksen elinkierron kannalta, mutta reaktivoitumisen tarkkoja säätelymekanismeja ei kuitenkaan täysin tunneta.
group logo
Hankkeen kesto
-
Tutkimuksen painoala
Luonnon perusilmiöt ja matemaattinen ajattelu
Tutkimusalue
Nanobiologia
Osasto
Bio- ja ympäristötieteiden laitos
Tiedekunta
Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta
Rahoitus
Suomen Akatemia

Hankekuvaus

Herpesviruksen reaktivoitumisen vaikutus isäntäsolun kromatiinin rakenteeseen ja dynamiikkaan on olennainen kysymys perustutkimukselle sekä onkolyyttisten virusterapioiden ja uusien virusreaktivointia estävien viruslääkkeiden kehittämiselle. Tämän projektin tavoitteena on tarkentaa viruksen reaktivoinnin mekanismeja sekä kromatiinin järjestäytymisen ja faasiseparaation rooleja tässä prosessissa. Tutkimus toteutetaan Jyväskylän yliopistossa, ja siinä käytetään monitieteistä lähestymistapaa, joka yhdistää solubiologian ja biofysiikan edistyneisiin kuvantamistekniikoihin, proteiinirakenteen ennustusalgoritmeihin ja biofysikaaliseen mallinnukseen.

Julkaisut

Hanketiimi