DNA:n sijoittuminen ja vuorovaikutukset herpesviruksen reaktivoinnissa

Kromatiinin järjestäytymistä solun tuman sisällä ohjataan useilla tasoilla. Herpesvirukset, kuten Herpes simplex 1 -virus, replikoituvat ja ylläpitävät genomiaan isäntäsolun ytimessä ja hyödyntävät isäntäsolujen ydinrakenteita sekä lyytisen että latentin infektion aikana. Nukleosomien translaation jälkeisen muokkauksen lisäksi isännän kromatiini vuorovaikutusten modulaatio on olennaista viruksen elinkierron kannalta, mutta reaktivoitumisen tarkkoja säätelymekanismeja ei kuitenkaan täysin tunneta.
group logo

Sisällysluettelo

Hankkeen kesto
-
Tutkimuksen painoala
Luonnon perusilmiöt ja matemaattinen ajattelu
Tutkimusalue
Nanobiologia
Osasto
Bio- ja ympäristötieteiden laitos
Tiedekunta
Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta
Rahoitus
Suomen Akatemia

Hankekuvaus

Herpesviruksen reaktivoitumisen vaikutus isäntäsolun kromatiinin rakenteeseen ja dynamiikkaan on olennainen kysymys perustutkimukselle sekä onkolyyttisten virusterapioiden ja uusien virusreaktivointia estävien viruslääkkeiden kehittämiselle. Tämän projektin tavoitteena on tarkentaa viruksen reaktivoinnin mekanismeja sekä kromatiinin järjestäytymisen ja faasiseparaation rooleja tässä prosessissa. Tutkimus toteutetaan Jyväskylän yliopistossa, ja siinä käytetään monitieteistä lähestymistapaa, joka yhdistää solubiologian ja biofysiikan edistyneisiin kuvantamistekniikoihin, proteiinirakenteen ennustusalgoritmeihin ja biofysikaaliseen mallinnukseen.

Julkaisut

Julkaisu
2024

Herpesvirus-Induced Manipulation of the Nucleolus

Microscopy and Microanalysis.
Leclerc, Simon
Kapishnikov, Sergey
Ruokolainen, Visa
Huusko, Inka
Mattola, Salla
Rogers, David
O´Connor, Stephen
Aho, Vesa
Fahy, Kenneth
Vihinen-Ranta, Maija
Julkaisu
2024

Progression of herpesvirus infection remodels mitochondrial organization and metabolism

PLoS pathogens.
Leclerc, Simon
Gupta, Alka
Ruokolainen, Visa
Chen, Jian-Hua
Kunnas, Kari
Ekman, Axel A.
Niskanen, Henri
Belevich, Ilya
Vihinen, Helena
Turkki, Paula
Perez-Berna, Ana J.
Kapishnikov, Sergey
Mäntylä, Elina
Harkiolaki, Maria
Dufour, Eric
Hytönen, Vesa
Pereiro, Eva
McEnroe, Tony
Fahy, Kenneth
Kaikkonen, Minna U.
Jokitalo, Eija
Larabell, Carolyn A.
Weinhardt, Venera
Mattola, Salla
Aho, Vesa
Vihinen-Ranta, Maija
Julkaisu
2022

Nuclear entry and egress of parvoviruses

Molecular Microbiology.
Mattola, Salla
Aho, Vesa
Bustamante‐Jaramillo, Luisa F.
Pizzioli, Edoardo
Kann, Michael
Vihinen‐Ranta, Maija
Julkaisu
2021

Functional roles of the membrane-associated AAV protein MAAP

Scientific Reports.
Galibert, Lionel
Hyvönen, Amira
Eriksson, Reetta A. E.
Mattola, Salla
Aho, Vesa
Salminen, Sami
Albers, Justin D.
Peltola, Sanna K.
Weman, Saija
Nieminen, Tiina
Ylä-Herttuala, Seppo
Lesch, Hanna P.
Vihinen-Ranta, Maija
Airenne, Kari J.

Hanketiimi

Hankkeen vetäjät

Salla Mattola
Akatemiatutkija

Jäsenet

Jenni Auramo
Väitöskirjatutkija

Tutkimusryhmät

Tutkimusryhmä

Virus-nucleus interactions

Virus-nucleus interactions