Fonsén työskentelee Koulutusjohtamisen apulaisprofessorina. Hänellä on Itä-Suomen yliopistoon dosentuuri vuodesta 2019. Fonsénin aiempi työkokemus on Helsingin yliopistosta, jossa hän toimi yliopistonlehtorina ja Kasvatustieteiden osaston varajohtajana. Sitä ennen hän työskenteli Tampereen yliopistossa yliopistonlehtorina, opetustehtävissä ja projektikoordinaattorina. Aikaisemmalta ammatiltaan Fonsén on varhaiskasvatuksen opettaja, ja työskenteli pääasiassa Pirkkalassa ja Tampereella.
Fonsénin väitöskirja vuodelta 2014 käsitteli pedagogista johtajuutta varhaiskasvatuksessa. Tutkimusintressit ovat sen jälkeen kohdentuneet kasvatus- ja koulutusalan johtajuuteen, ja mm. johtajuuden diskursseihin sekä ammatilliseen kehittymiseen. Fonsén on johtanut useita kansallisia ja kansainvälisiä tutkimusprojekteja (Discourse of leadership in the diverse field of early childhood education, Vepo johtajuus 2035 - development and research project of leadership studies for the educational field, Eduleaders, Sääntökirjat etc.) ja osatutkimuksia (Ohoske, Vakatuki etc.).
Hän on Suomen varhaiskasvatus ry:n hallituksen jäsen ja johtaa kansainvälistä varhaiskasvatuksen johtajuustutkijoiden foorumia, the International Leadership Research Forum (ILRF -EC). Hän on myös Kasvatustieteellisen seuran SIG:n Sivistys, hallinto ja tutkimus johtoryhmän jäsen.
