Opiskelijan kokemuksia kandidaatin tutkielman teosta yhteistyönä Keski-Suomen hyvinvointipalveluiden kanssa

Jyväskylän yliopistossa opiskelija voi työstää kandidaatin tutkielman halutessaan myös yhteistyössä yrityksen tai organisaation kanssa. Näin teki kemian laitoksen opiskelija Vilma Niemi, joka teki kandidaatin tutkielman kokeellisen osuuden Keski-Suomen hyvinvointipalveluiden kanssa Keski-Suomen sairaala Novan patologian yksikössä. Yhteistyö eri organisaatioiden kanssa luo opiskelijoille uudenlaisia mahdollisuuksia urapolkuihin ja aiheita loppututkielmiin.

- Laboratorio-osuus Sairaala Novassa toimi korvaamattomana oppimiskokemuksena, sillä opin käyttämään uudenlaista laitteistoa, automaattipipettejä sekä kliinisen laboratorioympäristön käytänteistä. Käytännön kokemus vahvisti teoreettista tietoa ja tarjosi käytännön perustan tulevalle, iloitsee Vilma Niemi Jyväskylän yliopistosta.

Rinta- ja keuhkosyövän molekyyliprofilointia

Viime vuosikymmeninä lääketieteen ja tekniikan kehityksen myötä syöpädiagnostiikan työkalut ovat harpanneet merkittäviä askeleita eteenpäin. Teknologian kehittyminen on mahdollistanut keskittymisen yhä pienempiin mittakaavoihin patologian tutkimuksessa. Molekyylipatologian aikakausi alkoi PCR-teknologian kehittymisestä 1990-luvulla. Tänä päivänä on päästy kehityksessä pisteeseen, jossa lääketiede on yhä yksilöllisempää ja molekyylitason diagnostiikka on arkipäivää kliinisessä työssä.

Niemen kandidaatin tutkielma keskittyi rinta- ja keuhkosyöpiin sisältäen sekä kirjallisuuskatsauksen että kokeellisen osuuden.  Kirjallinen osuus tarkasteli molekyyliprofiloinnin perusteita, yleisimpiä menetelmiä ja niissä hyödynnettäviä biomarkkereita. Lisäksi kirjallisessa osassa tarkasteltiin perinteisiin patologian menetelmiin kuuluvien uusien biomarkkereiden käyttökelpoisuutta. 

- Kokeellisessa osassa, eli laboratorioprojektissa tavoitteena oli vertailla digitaalisesta dropletti PCR:tä ja massiivisesta paralleelisekvensoinnista saatuja tuloksia ja laitteistojen herkkyyttä keskenään. Laboratorioprojektin tulokset tukivat aiemmin julkaistuja tutkimuksia, kertoo Niemi. 

Kokemusta ja kontakteja

Idea kandidaatin tutkielmaan lähti, kun Niemi huomasi, että kemian laitos tiivistää yhteistyötä mm. Sairaala Novan ja Keski-Suomen Biopankin kanssa. Lisäksi häntä on lukiosta lähtien kiinnostanut kliininen kemia ja sairaalamaailmassa työskentely.  

- Jotkut kokevat tutkielmien tekemisen työlääksi. Kun sai olla mukana valitsemassa itselleen sopivaa aihetta, sujui tutkielman tekeminen ja se oli kiinnostavaa. Mielenkiintoista oli myös se, että pääsi konkreettisesti yhdistämään käytännön ja teorian, kertoo Niemi.

Kandidaatin tutkielman teko sairaalassa johti myös uusien kontaktien luomiseen esimerkiksi jyväskyläläisen startup-yritys BiopSensen kanssa, joka on saanut alkunsa professori Marja Tiirolan työryhmän tutkimuksista Jyväskylän yliopiston bio- ja ympäristötieteen laitoksella ja nanotiedekeskuksessa. BiopSense työllistää noin kymmenen Jyväskylän yliopistosta valmistunutta molekyylibiologia, jotka kehittävät Niemenkin tutkimuksessa käytettyjen biomarkkereiden analysointia nopeuttavaa teknologiaa.

- Neuvoni kaikille opiskelijoille on, että tarttukaa kiinnostaviin tilanteisiin ja mahdollisuuksiin. Koskaan ei tiedä, mistä itsensä löytää ja minkälaisia kontakteja ja verkostoja pääsee luomaan. Ne voivat myös tulevaisuudessa olla hyödyllisiä, sanoo Niemi.

Omannäköistä opiskelua

Luonnontieteet olivat Niemen sydäntä lähellä jo lukioaikana. Erityisesti lääketieteellinen osaaminen on ollut aina syvästi sidoksissa hänen elämäänsä ja pitkään hän mietti jopa lääketieteelliseen hakemista. Lopulta kemia vei kuitenkin voiton. Lukion jälkeen välivuosi oli Niemellä edessä, mutta Jyväskylän yliopiston avoimen väylä mahdollisti hänelle täydellisen polun opintojen jatkamiseen ilman pitkiä taukoja. 

- Edelleen lääketiede kiinnostaa minua, mutta onneksi Jyväskylän yliopistossa voi opiskella vapaasti esimerkiksi biologian alan kursseja ja voin syventää omaa lääketieteen osaamista. Myös harjoittelupaikat ja tutkielman teko ulkopuolisen organisaation kanssa mahdollistaa juuri oman näköisen opiskelun, iloitsee Niemi. 

Tutkielman ohjaajina toimivat kemian laitoksen työelämäprofessori Sauli Vuoti ja Sairaala Novan molekyylibiologi Laura Lahtinen. 

Kandidaatin tutkielma “Rinta- ja keuhkosyövän molekyyliprofiloinnin modernit menetelmät” on luettavissa JYX-julkaisuarkistossa:  https://jyx.jyu.fi/jyx/Record/jyx_123456789_99203# 

Lisätietoja:  

• Opiskelija Vilma Niemi, vilma.a.niemi@jyu.fi