BENA2007 Molekyylimikrobiologian laboratoriokurssi (5 op)
Osaamistavoitteet
Opintojakson suoritettuaan opiskelija:
- hallitsee DNA-tekniikoiden perusteet käytännössä
- ymmärtää yhdistelmä-DNA -tekniikan työvaiheet ja eri työvaiheissa käytettävien kontrollireaktioiden merkityksen
- omaa perustiedot perinteisestä Sanger-sekvensoinnista, sekvenssiaineiston käsittelystä ja tietokantahausta
- osaa laboratoriotöiden hyvän raportointikäytännön ja laboratoriokirjanpidon.
Suoritustavat
Luennot, kurssityöt ja kurssityöstä kirjoitettu raportti.
Sisältö
Kurssilla tutustutaan molekyylimikrobiologian jokapäiväisiin menetelmiin käytännön laboratoriotyöskentelyn kautta. Kurssilla tunnistetaan bakteerilaji opiskelijoiden hankkimasta lähtömateriaalista. Työvaiheisiin kuuluvat DNA-eristys, PCR yhdistelmäplasmidin valmistus, kloonaus, sekvensointi ja haku sekvenssitietokannasta. Lisäksi tutustutaan qPCR-menetelmään. Kurssityöstä kirjoitetaan raportti. Luennot ja seminaarityö.
Oppimateriaalit
Kurssilla jaettava materiaali.
Arviointiperusteet
seminaarityö, raportti, tentti
Esitietovaatimukset
BENA2003 Labortoriotyötavat ja -turvallisuus
BENA2004 Genetiikka